Bioinformatique Avancée

Les éléments transposables (TE) constituent 60% du génome humain mais sont généralement écartés des analyses en raison de leur caractère répétitif et de leur complexité. Comme les éléments transposables peuvent réguler l'expression des gènes et recruter des facteurs de transcription, leur analyse peut aider à découvrir une nouvelle facette de vos données. Leur expression dans les maladies et leurs séquences particulières en font des cibles de choix pour la découverte de marqueurs biologiques et de nouvelles thérapies. Nous avons développé TEnex, un ensemble de pipelines et de programmes optimisés et évalués par des pairs pour analyser les éléments transposables dans les données -omiques. Profitez de notre base de données TE et de nos 10 ans d'expérience dans le domaine.

Les éléments transposables (TE) ne sont plus considérés comme de simples répétitions génomiques inertes. Un nombre croissant de publications démontre qu'ils façonnent activement la régulation des gènes en fournissant des promoteurs, des enhancers, des sites d'épissage et des motifs de liaison aux facteurs de transcription, ou en générant de nouveaux transcrits chimériques. Les éléments régulateurs dérivés des TE sont désormais reconnus comme étant cooptés par le génome hôte et intégrés dans les réseaux transcriptionnels fondamentaux. Dans le cancer et d'autres maladies, l'expression des TE est fréquemment dérégulée. Des familles de TE spécifiques présentent des schémas d'activation robustes et reproductibles à travers différents types de tumeurs, souvent corrélés à des altérations épigénétiques, une activation immunitaire et le pronostic des patients. Ces propriétés font des TE de puissants biomarqueurs pour le diagnostic, le pronostic et la réponse aux traitements, comme cela a déjà été démontré dans de multiples études transcriptomiques à grande échelle. L'analyse des TE nécessite des méthodes dédiées qui tiennent compte de leur nature répétitive, d'une normalisation délicate et d'une régulation au niveau des familles. Les pipelines RNA-seq génériques ne parviennent pas à capturer ce signal. Avec plus d'une décennie d'expertise en biologie des TE et des cadres analytiques spécialement conçus, Nexco Analytics est idéalement positionné pour vous aider à révéler le potentiel de biomarqueurs caché dans la face obscure du génome.

Dans le domaine de la bioinformatique, les solutions personnalisées basées sur les technologies avancées surpassent les approches standard. Lorsque les analyses se compliquent et que les méthodes standard atteignent leurs limites, ce qui est le cas dans la plupart des cas, les analyses avancées deviennent indispensables. Nos services offrent des prestations sur mesure qui dépassent les limites conventionnelles, garantissant que vos données soient pleinement comprises et permettant des avancées de recherche révolutionnaires.