RNA-seq
Votre solution sur mesure pour l'analyse RNA-seq
La technique RNA-seq a révolutionné la transcriptomique en une décennie en permettant le séquençage de la totalité de l'ARN d'un échantillon. Depuis, de multiples méthodes ont été implémentées afin d'analyser correctement le RNA-seq et nous sommes devenus des experts quant à leur compréhension et application.
TEnex: notre pipeline sous licence pour l'analyse RNA-seq
Le standard pour l'analyse RNA-seq est d'extraire les gènes différemment exprimés entre différentes conditions. En tant que spécialiste du génome répété, nous pouvons aller plus loin en analysant les éléments transposables du génome. Ces derniers peuvent altérer l'expression des gènes et ont été montré comme jouant un role dans les maladies, notamment le cancer.
Notre méthode pour analyser les éléments transposables, nommée TEnex, a été développée à l'EPFL et est sous licence. Notre méthode a été revue par des pairs et vous pouvez optionnellement en bénéficier pour vos analyses.
Nos analyses suivent les standards et sont adaptables à vos besoins. Nous utilisons les méthodes statistiques qui minimisent les faux positifs afin de vous fournir une liste robuste de gènes différentiellement exprimés.
Profitez de nos années d'expérience en Machine Learning
Des données brutes aux données traitées, Nexco Analytics peut vous aider dans tous les cas. Nous avons travaillé avec des données transcriptomiques depuis 15 ans et pouvons intervenir à tous les stades de l'analyse.
Nous pouvons vous aider à comprendre l'importance des gènes découverts lors de vos analyses grâce à de nombreux outils comme le « gene set enrichment analysis », « gene ontology » ou « cell type deconvolution ».
Nous utilisons des méthodes avancées de Machine Learning afin de découvrir des motifs cachés dans vos données, du simple clustering ou du standard « principal component analysis », aux techniques plus avancées de modélisations statistiques, comme la régression et le « random forest » pour en citer quelques unes.
© 2024 Nexco Analytics. All Rights Reserved.