Bioinformatica Avanzata

Gli elementi trasponibili (ET) costituiscono il 60% del genoma umano, eppure di solito vengono scartati dalle analisi a causa della loro ripetitività e complessità. Poiché gli ET possono regolare l'espressione genica e fungere da sito di legame per i fattori di trascrizione, la loro analisi può aiutare a comprendere la biologia nascosta nei vostri dati. La loro espressione nelle malattie e le loro sequenze peculiari li rendono un ottimo bersaglio per la scoperta di biomarcatori e per la terapia. Abbiamo sviluppato TEnex, un insieme di pipeline e programmi ottimizzati e sottoposti a revisione paritaria per analizzare gli elementi trasponibili nei dati omici. Approfittate del nostro database curato di ET e di 10 anni di esperienza nel campo.

Gli elementi trasponibili (ET) non sono più considerati ripetizioni genomiche inerti. Un crescente corpo di letteratura dimostra che modellano attivamente la regolazione genica fornendo promotori, potenziatori (enhancer), siti di splicing e motivi di legame per i fattori di trascrizione, o generando nuovi trascritti chimerici. Gli elementi regolatori derivati dagli ET sono oggi noti per essere cooptati dal genoma ospite e integrati nelle reti trascrizionali fondamentali. Nel cancro e in altre malattie, l'espressione degli ET è frequentemente deregolata. Famiglie specifiche di ET mostrano pattern di attivazione robusti e riproducibili tra diversi tipi di tumore, spesso correlati ad alterazioni epigenetiche, attivazione immunitaria e prognosi del paziente. Queste proprietà rendono gli ET potenti biomarcatori per la diagnosi, la prognosi e la risposta al trattamento, come già dimostrato in molteplici studi trascrittomici su larga scala. L'analisi degli ET richiede metodi dedicati che tengano conto della loro natura ripetitiva, della normalizzazione complessa e della regolazione a livello di famiglia. Le pipeline standard di RNA-seq non riescono a catturare questo segnale. Con oltre un decennio di esperienza nella biologia degli ET e framework analitici appositamente sviluppati, Nexco Analytics è in una posizione unica per aiutarvi a sbloccare il potenziale dei biomarcatori nascosti nel genoma oscuro.

Nel campo della bioinformatica, le soluzioni personalizzate guidate dai progressi tecnologici superano gli approcci standard. Quando sorgono complessità e i metodi standard non sono all'altezza, il che accade nella maggior parte dei casi, le analisi avanzate diventano imperative. I nostri servizi offrono approfondimenti su misura che trascendono i limiti convenzionali, garantendo che i vostri dati siano compresi appieno e consentendo passi avanti rivoluzionari nella ricerca.