ChIP-seq, una base per l'epigenomica

L'epigenomica ha acquisito un ruolo preponderante nello studio della genomica. Complementare allo studio dell'espressione genica tramite tecniche di trascrittomica come RNA-seq o scRNA-seq, l'indagine dello stato della cromatina nei loci di interesse è diventata cruciale per comprendere l'espressione genica. L'immunoprecipitazione della cromatina seguita dal sequenziamento del DNA (ChIP-seq) è una tecnica fondamentale in epigenomica per la quale abbiamo anni di esperienza.

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Rivela i siti di legame delle proteine e scopri i motivi del DNA

Il ChIP-seq permette di studiare il pattern di legame della vostra proteina di interesse attraverso l'intero genoma. Il metodo di Nexco Analytics per analizzare il ChIP-seq e inferire i siti di legame (picchi) è conforme agli standard attuali. La nostra pipeline si concentra prima sul controllo di qualità per scartare qualsiasi bias e per minimizzare i falsi negativi utilizzando statistiche avanzate.

La scoperta di motivi è solitamente il passo successivo nell'analisi. Scoprite la sequenza di DNA che recluta la vostra proteina di interesse nei vostri dati approfittando della nostra pipeline di rilevamento dei motivi.