Fortgeschrittene Bioinformatik

Transponierbare Elemente (TEs) machen 60 % des menschlichen Genoms aus, werden aber aufgrund ihrer Repetitivität und Komplexität normalerweise von Analysen ausgeschlossen. Da TEs die Genexpression regulieren und als Andockstellen für Transkriptionsfaktoren dienen können, kann ihre Analyse helfen, die in Ihren Daten verborgene Biologie zu verstehen. Ihre Expression bei Krankheiten und ihre besonderen Sequenzen machen sie zu einem großartigen Ziel für die Entdeckung von Biomarkern und für Therapien. Wir haben TEnex entwickelt, eine Reihe optimierter und Peer-Review-geprüfter Pipelines und Programme zur Analyse von transponierbaren Elementen in Omics-Daten. Profitieren Sie von unserer kuratierten TE-Datenbank und 10 Jahren Erfahrung auf diesem Gebiet.

Transponierbare Elemente (TEs) gelten nicht mehr als inerte genomische Wiederholungen. Eine wachsende Zahl von Studien zeigt, dass sie die Genregulation aktiv mitgestalten, indem sie Promotoren, Enhancer, Spleißstellen und Transkriptionsfaktor-Bindungsmotive bereitstellen oder neuartige chimäre Transkripte erzeugen. Von TEs abgeleitete regulatorische Elemente werden nachweislich vom Wirtsgenom kooptiert und in zentrale Transkriptionsnetzwerke integriert. Bei Krebs und anderen Krankheiten ist die TE-Expression häufig dysreguliert. Bestimmte TE-Familien zeigen robuste, reproduzierbare Aktivierungsmuster über verschiedene Tumortypen hinweg, die oft mit epigenetischen Veränderungen, Immunaktivierung und Patientenergebnissen korrelieren. Diese Eigenschaften machen TEs zu leistungsstarken Biomarkern für Diagnose, Prognose und Therapieansprechen, wie bereits in mehreren groß angelegten transkriptomischen Studien nachgewiesen wurde. Die Analyse von TEs erfordert spezialisierte Methoden, die ihre repetitive Natur, komplexe Normalisierung und Regulation auf Familienebene berücksichtigen. Standard-RNA-seq-Pipelines können dieses Signal nicht erfassen. Mit über einem Jahrzehnt Expertise in der TE-Biologie und eigens entwickelten analytischen Frameworks ist Nexco Analytics einzigartig positioniert, um Ihnen zu helfen, das im dunklen Genom verborgene Biomarker-Potenzial zu erschließen.

Im Bereich der Bioinformatik übertreffen maßgeschneiderte Lösungen, die von technologischen Fortschritten angetrieben werden, Standardansätze. Wenn Komplexitäten auftreten und Standardmethoden versagen, was in den meisten Fällen der Fall ist, werden fortgeschrittene Analysen unerlässlich. Unsere Dienstleistungen bieten maßgeschneiderte Einblicke, die konventionelle Grenzen überschreiten, sicherstellen, dass Ihre Daten vollständig verstanden werden und bahnbrechende Forschungsschritte ermöglichen.