RNA-seq
Ihre maßgeschneiderte Lösung für die RNA-seq-Analyse
RNA-seq hat die Transkriptomik vor einem Jahrzehnt revolutioniert, indem es die Sequenzierung des gesamten mRNA-Gehalts einer Probe ermöglichte. Seitdem wurden viele Methoden implementiert, um Bulk-RNA-seq korrekt zu analysieren, und wir sind Experten darin geworden, sie zu verstehen und anzuwenden.
Lernen Sie TEnex kennen: unsere lizenzierte Pipeline für die RNA-seq-Analyse
Der Standard für die RNA-seq-Analyse besteht darin, differentiell exprimierte Gene zwischen den Bedingungen zu identifizieren. Als Spezialisten für repetitive DNA-Sequenzen können wir einen Schritt weiter gehen, indem wir transponierbare Elemente analysieren, die die Genexpression verändern können und nachweislich eine Rolle bei Krankheiten, insbesondere Krebs, spielen.
Unsere Peer-Review-geprüfte Pipeline zur Analyse transponierbarer Elemente (TE), die wir TEnex genannt haben, wurde an der EPFL entwickelt und ist an Nexco Analytics lizenziert. Wir können diese Informationen optional extrahieren, um die Standard-Genanalysen zu ergänzen.
Unsere Analysen entsprechen den Standards und sind an Ihre Bedürfnisse anpassbar. Wir wenden statistische Methoden an, die die Anzahl falsch-positiver Ergebnisse minimieren, um Ihnen einen robusten Satz differentiell exprimierter Gene zu liefern.
Profitieren Sie von maschinellem Lernen und jahrelanger Erfahrung
Ob Rohdaten oder verarbeitete Daten, Nexco Analytics kann in beiden Fällen helfen. Wir arbeiten seit über 15 Jahren in der Transkriptomik und können jede nachgeschaltete Analyse auf Ihre Daten anwenden.
Wir können Ihnen helfen, die biologische Relevanz der in Ihren Daten gefundenen Gene zu verstehen, indem wir verschiedene Werkzeuge wie Gen-Set-Anreicherung, Gen-Ontologie oder Zelltyp-Dekonvolution verwenden.
Wir wenden Techniken des maschinellen Lernens an, um verborgene Muster in den Daten aufzudecken, von einfachem Clustering oder Standard-Hauptkomponentenanalyse bis hin zu fortgeschritteneren statistischen Modellen wie Random Forest und Regression, um nur einige zu nennen.
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